Secuencia peptídica

También: secuencia de aminoácidos · peptide sequence · estructura primaria

Orden exacto de los aminoácidos de un péptido, escrito del extremo amino (N) al carboxilo (C) con códigos de una o tres letras y las modificaciones anotadas.

La secuencia es la estructura primaria del péptido y su identidad química: dos péptidos con la misma secuencia y las mismas modificaciones son el mismo compuesto, y basta un residuo distinto para que dejen de serlo. Se escribe siempre del extremo N-terminal al C-terminal. BPC-157 se escribe GEPPPGKPADDAGLV: quince letras, quince residuos, empezando por glicina y terminando en valina.

Las anotaciones alrededor de las letras forman parte de la secuencia. «Ac-» indica un extremo N acetilado, «-NH2» un extremo C amidado, «cyclo( )» un anillo y «D-» un aminoácido de configuración D. TB-500 es Ac-LKKTETQ; Melanotan-2 es Ac-Nle-cyclo(Asp-His-D-Phe-Arg-Trp-Lys)-NH2. Quitar una de esas anotaciones describe otra molécula, con otra masa y otro registro.

Cuando un péptido deriva de una hormona, los residuos se numeran según la hormona original aunque el fragmento sea más corto. Por eso se habla de «Aib8» y «Lys26» en semaglutida, que sigue la numeración de GLP-1(7-37), y de «GHRH(1-29)» para los primeros veintinueve residuos de la hormona liberadora de hormona de crecimiento. Esa convención explica muchos nombres que parecen arbitrarios.